Klubbens ungdomslag rekrutteres fra kommunens barne- og ungdomsskoler 7. -10. klasse, samt byens videregående skoler. På ungdomstrinnet er lagene kjønnsdelt og inndelt på følgende måte:
U13 – 7. klasse
U14 – 8. klasse
U15 – 9. klasse
U16 – 10. klasse
U17 – 1. gym
U19 – 3. gym
Formålet med aktiviteten i ungdomslagene er det samme som i skolelagene – gi ungene mestringsfølelse rundt bruk av egen kropp, skape gode treningsvaner i tidlig alder, samt utvikle gode og varige vennskap mellom ungdommene. I tillegg er ungdomslagene også en arena for de som vil satse på basket og på sikt spille for BLNO Kvinner eller Tromsø Storm.
Ungdomslagene trener to til fire gang pr uke, og deltar i Vinterligaen (lokalt seriespill for de yngste ungdomslagene), Regionserien (regionalt seriespill for ungdomslag i Region Nord), samt regionalt seriespill i Region Øst (Østlandet, gjelder ikke U13). I tillegg deltar klubben også med lag i NM-cupen.